54% в УК аэропорта контролируют кипрские офшоры Ивана Саввиди, 38% принадлежит правительству Ростовской области. Актив является предметом спора между чиновниками и Иваном Саввиди уже два года. ООО «Праймери Дон» предпринимателя получило контроль над аэропортом в 2003 году после того, как было принято решение не выплачивать дивиденды по итогам 2002 года. В результате привилегированные акции стали голосующими. С тех пор аэропорт не платил дивиденды. В 2011 году правительство Ростовской области заключило с «Реновой» Виктора Вексельберга соглашение о строительстве нового аэропорта «Южный» под Ростовом. Область входила в проект имуществом и акциями действующего аэропорта. Однако договориться с Иваном Саввиди о продаже его доли в аэропорту не удалось, поэтому властям пришлось действовать через суд. В октябре арбитражный суд Ростовской области по иску минимущества обязал аэропорт выплатить дивиденды на привилегированные акции по итогам января–сентября 2012 года, в начале ноября — за весь 2012 год (10% от чистой прибыли). Осенью же стало стало известно, что контрольный пакет ОАО был переведен на кипрские офшоры, а затем реализован «Новапорту» Романа Троценко. Однако продажа так и не состоялась. По предположению аналитиков, основной причиной срыва сделки стали судебные споры вокруг предприятия.

Чтобы сохранить контроль над аэропортом, структуры господина Саввиди инициировали 5 декабря проведение собрания акционеров, на котором планировалось увеличить уставный капитал общества на 733,039 млн руб. путем повышения номинальной стоимости обыкновенных и привилегированных акций, что размывало долю минимущества. Однако область через суд добилась запрета на проведение собрания. После этого в декабре 2013 года министерство обратилось в суд с несколькими обеспечительными исками, фактически лишающими структуры Ивана Саввиди возможности принимать любые решения по работе предприятия.